Les CUP doblen el nombre de llistes electorals que es van presentar el 2003
A més, presenten candidatures en coalició amb els Verds a Badalona i Granollers. També s'han presentat catorze candidatures en què les CUP participen en plataformes més àmplies. Aquesta fórmula és utilitzada en municipis destacats com Tarragona, Sabadell, Cerdanyola del Vallès o Santa Coloma de Gramenet. A més, dues de les llistes també es fan en coalició amb Iniciativa i altres amb independents, concretament a Palamós i Salt. L'any 2003, les CUP van aconseguir un regidor a Vilafranca del Penedès, a Valls i a Viladamat, dos a Sallent i Torà i tres a Arbúcies. Entre els eixos programàtics de les CUP per a les municipals hi ha un aprofundiment en la democràcia participativa; «fer dels municipis un dels principals motors en la reconstrucció nacional dels Països Catalans»; un desenvolupament «econòmic, social i territorial realment sostenible»; uns municipis «integrats, socialment igualitaris i solidaris» i una «dinamització del teixit associatiu i la promoció de l'autoorganització ciutadana».